各種細菌所具有的酶系統(tǒng)不盡相同,對營養(yǎng)基質(zhì)的分解能力也不一樣,因而代謝產(chǎn)物或多或少地各有區(qū)別,可供鑒別細菌之用.用生化試驗的方法檢測細菌對各種基質(zhì)的代謝作用及其代謝產(chǎn)物,從而鑒別細菌的種屬,稱之為細菌的生化反應(yīng)。

(1)、糖(醇)類發(fā)酵試驗

不同的細菌含有發(fā)酵不同糖(醇)的酶,因而發(fā)酵糖(醇)的能力各不相同.其產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物亦不相同,如有的產(chǎn)酸產(chǎn)氣,有的產(chǎn)酸不產(chǎn)氣.酸的產(chǎn)生可利用指示劑來判定.在配制培養(yǎng)基時預(yù)先加入溟甲酚紫［P HS. 2(黃色)一6 . 8 (紫色)],當(dāng)發(fā)酵產(chǎn)酸時,可使培養(yǎng)基由紫色變?yōu)辄S色.氣體產(chǎn)生可由發(fā)酵管中倒置的杜氏小管中有無氣泡來證明.例如：甘/露醇發(fā)酵試驗。

(2)、甲基紅(Methylred)試驗(該試驗簡稱MR試驗)

很多細菌,如大腸桿菌等分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸,丙酮酸再被分解,產(chǎn)生甲酸、乙酸、乳酸等,使培養(yǎng)基的pH 降低到4 . 2 以下,這時若加甲基紅指示劑呈現(xiàn)紅色.因甲基紅指示劑變色范圍是pH4 . 4 (紅色)一pH6 . 2 (黃色).若某些細菌如產(chǎn)氣桿菌,分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸,但很快將丙酮酸脫梭,轉(zhuǎn)化成醇等物,則培養(yǎng)基的pH 仍在6 . 2 以上,故此時加入甲基紅指示劑,呈現(xiàn)黃色。

(3)、靛基質(zhì)(吲哚)試驗

某些細菌,如大腸桿菌,能分解蛋白質(zhì)中的色氨/酸,產(chǎn)生靛基質(zhì)(吲哚),靛基質(zhì)與對二甲基氨基苯/甲醛結(jié)合,形成玫瑰色靛基質(zhì)(紅色化合物)。

(4）氨基酸脫羧酶試驗

具有氨基酸脫羧酶的細菌，能分解氨基酸使其脫羧生成胺（賴氨酸→尸胺，鳥氨/酸→腐胺，精氨/酸→精胺）和二氧化碳，使培養(yǎng)基變堿。使指示劑顯示出來。結(jié)果：對照管應(yīng)呈黃色，試驗管呈藍綠色（指示劑為溴麝香/草酚藍）為陽性，若試驗管呈黃色為陰性。若對照管呈現(xiàn)藍-綠色則試驗無意義，不能作出判斷。這主要用于腸桿菌科細菌的鑒定。例如：賴氨酸脫羧酶利用試驗。

（5）淀粉水解試驗

細菌對大分子的淀粉不能直接利用,須靠產(chǎn)生的胞外酶(淀粉/酶)將淀粉水解為小分子糊精或進一步水解為葡萄糖(或麥芽糖),再被細菌吸收利用,細菌水解淀粉的過程可通過底物的變化來證明,即用碘測定不再產(chǎn)生藍色。

（6）硫化氫試驗

某些細菌能分解含硫的氨基酸(肌氨酸、半肌氨酸等),產(chǎn)生硫化氫,硫化氫與培養(yǎng)基中的鉛鹽或鐵鹽,形成黑色沉淀硫化鉛或硫化鐵.為硫化氫試驗陽性,可借以鑒別細菌。

(7)、檸檬酸鹽利用試驗

檸檬酸鹽培養(yǎng)基系一綜合性培養(yǎng)基,其中檸檬酸鈉為碳的唯1來源.而磷酸二氫按是氮的唯1來源.有的細菌如產(chǎn)氣桿菌,能利用檸檬酸鈉為碳源,因此能在檸檬酸鹽培養(yǎng)基上生長,并分解檸檬酸鹽后產(chǎn)生碳酸鹽,使培養(yǎng)基變?yōu)閴A性.此時培養(yǎng)基中的溟廖香草酚藍指示劑由綠色變?yōu)樯钏{色.不能利用檸檬酸鹽為碳源的細菌,在該培養(yǎng)基上不生長,培養(yǎng)基不變色。