原核生物轉(zhuǎn)錄作用生成的mRNA屬于多順反子mRNA，即由操縱子機(jī)制控制生成的一條mRNA可編碼幾種不同的蛋白質(zhì)。原核生物轉(zhuǎn)錄生成的初級(jí)轉(zhuǎn)錄本mRNA不需經(jīng)過復(fù)雜的加工過程即可表現(xiàn)功能，惟一的加工過程是多順反子mRNA在RnaseⅢ的催化下裂解為單個(gè)的順反子。

       真核生物轉(zhuǎn)錄生成的是單順反子mRNA，其前體是非均一RNA(hnRNA)。hnRNA加工過程包括

1.剪接

真核生物的基因是一種斷裂基因，即其結(jié)構(gòu)基因由若干編碼序列和非編碼序相間排列而成，其中為蛋白質(zhì)編碼的可轉(zhuǎn)錄序列稱為外顯子，不為蛋白質(zhì)編碼的可轉(zhuǎn)錄序列為內(nèi)含子。轉(zhuǎn)錄合成的hnRNA需經(jīng)過剪接、切掉內(nèi)含子部分，然后再將外顯子部分拼接起來。該過程有多種酶活性物質(zhì)(包括snRNA)參與。

2.5′末端加“帽”

真核細(xì)胞成熟mRNA的5′末端均有一個(gè)特殊的結(jié)構(gòu)，即m7Gpp-pmnNp，稱為“帽”。帽的生成是在細(xì)胞核內(nèi)進(jìn)行的，但胞漿中也有酶體系，動(dòng)物病毒mRNA加帽過程就是在宿主細(xì)胞的胞漿內(nèi)進(jìn)行的。

3.3′末端加“尾”

mRNA前體分子的3′末端有一段保守序列，由特異的核酸內(nèi)切酶切去多余的核苷酸，然后在多聚A聚合酶的催化下，由ATP聚合生成多聚A尾。該反應(yīng)在核內(nèi)發(fā)生，在胞漿中也可繼續(xù)進(jìn)行。

4.堿基修飾

mRNA分子中有少量稀有堿基(如甲基化堿基)是在轉(zhuǎn)錄后經(jīng)化學(xué)修飾(如甲基化)而形成的。

5.選擇性加工

某些MRNA前體含有多個(gè)3‘剪切位點(diǎn)和多聚腺苷酸化位點(diǎn)，因此利用這些選擇性位點(diǎn)可產(chǎn)生具有不同3'端非編碼區(qū)或者具有不同編碼能力的RNA產(chǎn)物。通過可變剪接途徑可以挑先保留在MRNA中的外顯子，結(jié)果單個(gè)基因可以合成多種不同的蛋白質(zhì)。

6.RNA編輯

在合成并經(jīng)RNA編輯加工之后，MRNA分子的序列可以發(fā)生改變。個(gè)別核苷酸可以被置換，添加或者刪除。編輯過的MRNA翻譯產(chǎn)生了較短脫脂基蛋白B48，由于基缺少一個(gè)結(jié)合受體的蛋白結(jié)構(gòu)域，因此功能受限。還有好多其他編輯的例子，陣錐蟲線粒體MRNA發(fā)生RNA編輯，使得終MRNA中一半以上的尿嘧啶都獲自編輯過程。